Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCKARP32238 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCKARP32238 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms