Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TSPOP30536 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TSPOP30536 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms