Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HLA-FP30511 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms