Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms