Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJB2P29033 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJB2P29033 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJB2P29033 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms