Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms