Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HRCP23327 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HRCP23327 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HRCP23327 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRCP23327 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRCP23327 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRCP23327 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HRCP23327 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HRCP23327 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HRCP23327 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HRCP23327 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms