Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BGNP21810 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms