Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL9A1P20849 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms