Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CXCL3P19876 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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