Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDCP19113 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDCP19113 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDCP19113 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDCP19113 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDCP19113 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDCP19113 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDCP19113 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDCP19113 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDCP19113 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDCP19113 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDCP19113 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDCP19113 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDCP19113 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms