Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms