Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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PKHD1P08F94 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PKHD1P08F94 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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PKHD1P08F94 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PKHD1P08F94 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PKHD1P08F94 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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PKHD1P08F94 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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