Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSLP07711 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTSLP07711 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms