Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACSL4O60488 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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