Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGTAO43765 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGTAO43765 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms