Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCAO15360 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FANCAO15360 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCAO15360 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCAO15360 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCAO15360 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCAO15360 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCAO15360 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCAO15360 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCAO15360 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCAO15360 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms