Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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CEP290O15078 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CEP290O15078 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CEP290O15078 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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