Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRTO14522 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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