Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms