Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms