Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms