Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARID3CA6NKF2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARID3CA6NKF2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms