Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms