Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YBX2Q9Y2T7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
YBX2Q9Y2T7 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms