Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMPRSS11EQ9UL52 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMPRSS11EQ9UL52 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms