Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms