Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms