Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms