Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TREX1Q9NSU2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms