Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GKN1Q9NS71 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GKN1Q9NS71 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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GKN1Q9NS71 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GKN1Q9NS71 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GKN1Q9NS71 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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