Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms