Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRPV4Q9HBA0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPV4Q9HBA0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPV4Q9HBA0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPV4Q9HBA0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRPV4Q9HBA0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPV4Q9HBA0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPV4Q9HBA0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPV4Q9HBA0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPV4Q9HBA0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRPV4Q9HBA0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms