Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms