Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms