Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRRTQ9BXP5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRRTQ9BXP5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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