Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLVAPQ9BX97 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLVAPQ9BX97 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms