Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC106Q9BWC9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC106Q9BWC9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms