Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SORT1Q99523 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SORT1Q99523 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SORT1Q99523 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms