Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNX1Q96RV3 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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