Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COG3Q96JB2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms