Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SHDQ96IW2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHDQ96IW2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms