Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTV1Q96GA3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms