Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP3Q96DZ5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP3Q96DZ5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms