Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RTP4Q96DX8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms