Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF4BQ92750 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF4BQ92750 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms