Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHIPQ8WWQ0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHIPQ8WWQ0 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms