Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GIPC3Q8TF64 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms