Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms