Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CLDN19Q8N6F1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN19Q8N6F1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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